ミュウツーはポケットモンスターシリーズに登場するポケモンです。
ミュウツーは『赤緑』で登場した伝説のポケモンです。伝説のポケモンだけあって合計種族値が680という驚異的な数値を持っています。特に特攻と素早さが高く、技範囲も優秀なことから多くのポケモンに対応できる高速アタッカーとして活躍できます。
ミュウツーは『赤緑』『HGSS』で登場するハナダのどうくつの最深部に行くことで入手できます。また『金銀クリスタル』にもハナダのどうくつが登場しますが、ミュウツーはおらず、代わりにはかいのいでんしというアイテムが置かれています。
第五世代で初の専用技であるサイコブレイクを習得しました。サイコブレイクは威力100の特殊技で、攻撃する際に相手の特防ではなく防御を使ってダメージ計算を行います。同じ効果を持つサイコショックの上位互換であり、伝説のポケモンに付くにふさわしい専用技となっています。
劇場版作品「ミュウツーの逆襲」にて、タイトルを飾り物語の重要ポケモンとして登場します。ゲーム内で垣間見えるミュウツー誕生の物語にアレンジが加わり、ミュウツーを通して「命」や「自己の存在理由」というテーマを、見ている人々へ投げかけています。映画公開後にアニメでも、拘束具にして制御装置を身につけている「アーマードミュウツー」として登場、サカキの手持ちとしてトキワジムに挑むシゲルのポケモンを返り討ちにしていました。本来ならば、このトキワジムの回から劇場版へとつなげる予定でしたが、ポケモンショックと後に呼ばれている事件があったために放送がずれ込み、映画が放映開始してからトキワジムの話が放送されました。声は市村正親さんが担当しました。